芹菜缺氮不仅使植株生长受阻，叶片细小，而且叶柄易发生空心。前期缺磷，后期缺钾对芹菜产量和品质影响较大。芹菜对硼肥的反应非常敏感，缺硼时会出现裂茎症。大棚芹菜应科学浇水、施肥，提高芹菜产量和品质。
苗期小水勤浇。当芹菜芽顶土时，轻浇一次水，1~2天苗可出齐。以后保持土壤湿润，少量勤浇。浇水量过大，幼苗容易出现徒长或发生烂秧现象。苗高近10厘米时，可随水追肥1~2次。
定植缓苗后进行蹲苗。定植到缓苗要勤浇、轻浇保持土壤湿润。缓苗后，植株开始生长，应控制水量并进行中耕，促使根部下扎，心叶分化加速。若水分过大，外叶易徒长，叶心不发达，易发生病害。
营养生长期加大施肥量。蹲苗结束后，植株开始加速生长，应立即追施速效氮肥，以后分期追施1~2次钾肥。一般每隔3~4天浇一次水，灌水量可少些，以免地温过低不利于叶柄肥大。采收前半个月左右全株可喷30~50毫克/千克赤霉素1~2次。